Przy wyborze jednego z trzech opracowanych programów higienizacji bądź też indywidualnie dobranego programu higieny, bierzemy pod uwagę wiele różnych czynników. Należą do nich między innymi:
- Częstotliwość wykonywania zabiegów
- Występowanie chorób przewlekłych (insulinooporność, cukrzyca, Hashimoto, choroby tarczycy, wrzodziejące zapalenie jelit), występowanie u pacjenta lub w jego rodzinie chorób przyzębia (paradontozy)
- Obecność lub brak: zębów, uzupełnień protetycznych stałych (koron, mostów),
- Wypełnienia stomatologiczne, odbudowy stomatologii estetycznej typu bonding, implantów i uzupełnień na implantach
- Poziom świadomości, umiejętności pacjenta, także możliwość utrzymania odpowiedniej higieny domowej. Dotyczy to między innymi użytkowników aparatów ortodontycznych, uzupełnień protetycznych stałych i ruchomych na zębach własnych, uzupełnień protetycznych stałych i ruchomych na implantach, a także pacjentów w podeszłym wieku czy z paradontozą, u których mamy odsłonięte fragmenty korzeni w wyniku przebiegu choroby
- Styl życia i nawyki pacjenta (na przykład stres czy palenie papierosów)
